Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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