Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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GPNMBQ14956 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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GPNMBQ14956 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
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GPNMBQ14956 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
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GPNMBQ14956 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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GPNMBQ14956 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
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GPNMBQ14956 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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GPNMBQ14956 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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