Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
NEDD9Q14511 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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