Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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COL9A2Q14055 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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COL9A2Q14055 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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