Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
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PKP1Q13835 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
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PKP1Q13835 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
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