Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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