Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.4 ms