Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
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