Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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NFIAQ12857 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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NFIAQ12857 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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NFIAQ12857 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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NFIAQ12857 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
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