Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 ADAMTS3-201ENST00000286657 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 REG4-203ENST00000369401 2327 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 FGFR2-206ENST00000358487 4255 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 AC004852.1-201ENST00000605206 154 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 SLC8A1-AS1-228ENST00000627210 225 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 AP1M1-201ENST00000291439 13193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 NSD2-208ENST00000420906 5109 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 ZDBF2-201ENST00000374423 10286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 KIDINS220-201ENST00000256707 7361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 CACNB2-213ENST00000612134 3825 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 CKAP2-203ENST00000378037 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 ZNF605-202ENST00000360187 9340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 TAF1-203ENST00000373790 7629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 WDR44-203ENST00000371825 4029 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 DDX24-209ENST00000621632 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 MUM1L1-201ENST00000337685 4308 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 PPP1R1C-202ENST00000409137 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 ENPP5-202ENST00000371383 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 CD101-202ENST00000369470 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 CD46-205ENST00000358170 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 TMCO1-208ENST00000612311 4468 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 SLC2A14-201ENST00000340749 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 LIMA1-202ENST00000394943 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 AC040975.1-201ENST00000472104 316 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 AL356585.10-201ENST00000641883 123 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 CASR-205ENST00000639785 10047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 SOX6-202ENST00000396356 8865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 RABEP1-201ENST00000341923 2490 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 SETD5-204ENST00000406341 6582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 MYO6-207ENST00000615563 4026 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 FAM217B-202ENST00000360816 5036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 PIGN-201ENST00000357637 4723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 LRRC28-201ENST00000301981 5971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 CDH12-202ENST00000504376 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 NLRP14-201ENST00000299481 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 SHPRH-203ENST00000367505 7201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 MAATS1-201ENST00000273390 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 SLC39A12-204ENST00000539911 2461 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 ZNF793-207ENST00000587986 3869 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 PSMC2-201ENST00000292644 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 LHX9-201ENST00000367387 7836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 RNA5SP141-201ENST00000364543 120 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 FAUP2-201ENST00000394301 401 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 AL355862.1-201ENST00000412705 353 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 RN7SL55P-201ENST00000464534 297 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 RN7SL366P-201ENST00000577957 292 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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