Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C1orf53Q5VUE5 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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