Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
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CTF1Q16619 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
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CTF1Q16619 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
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CTF1Q16619 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
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CTF1Q16619 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
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CTF1Q16619 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
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CTF1Q16619 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CTF1Q16619 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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