Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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RPE65Q16518 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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RPE65Q16518 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
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RPE65Q16518 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
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RPE65Q16518 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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RPE65Q16518 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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