Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
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SNCBQ16143 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
SNCBQ16143 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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