Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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VAMP3Q15836 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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VAMP3Q15836 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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VAMP3Q15836 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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VAMP3Q15836 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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VAMP3Q15836 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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VAMP3Q15836 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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VAMP3Q15836 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
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VAMP3Q15836 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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VAMP3Q15836 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
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