Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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