Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms