Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 PHLPP2-201ENST00000393524 8467 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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NKX1-1Q15270 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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