Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AC010168.1-201ENST00000501178 657 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AC104248.1-201ENST00000522244 481 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 PPIAP32-201ENST00000449940 472 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
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