Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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