Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms