Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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