Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms