Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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LHX9Q9NQ69 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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LHX9Q9NQ69 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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LHX9Q9NQ69 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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LHX9Q9NQ69 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
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LHX9Q9NQ69 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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LHX9Q9NQ69 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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LHX9Q9NQ69 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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LHX9Q9NQ69 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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LHX9Q9NQ69 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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