Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TPRNQ4KMQ1 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.6 ms