Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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