Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms