Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms