Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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