Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
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RABGEF1Q9UJ41 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
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RABGEF1Q9UJ41 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
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RABGEF1Q9UJ41 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
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RABGEF1Q9UJ41 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
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RABGEF1Q9UJ41 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
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RABGEF1Q9UJ41 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
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