Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC3Q9BY71 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRC3Q9BY71 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRC3Q9BY71 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRC3Q9BY71 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRC3Q9BY71 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRC3Q9BY71 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRC3Q9BY71 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.4 ms