Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 DBIL5P2-201ENST00000443827 253 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AC106798.1-202ENST00000506819 589 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AC100849.2-201ENST00000518324 519 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AC138331.1-201ENST00000549993 376 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 PFDN5-214ENST00000551018 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 DSG1-AS1-204ENST00000581856 669 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AIG1-209ENST00000629020 3636 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 MSRB1P1-201ENST00000396851 354 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AC133644.1-201ENST00000398171 937 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 RPS26P6-201ENST00000475156 348 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
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