Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 CACNA1C-220ENST00000399655 13433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 ADA2-201ENST00000262607 3925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 TENM4-201ENST00000278550 14000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 OR2A5-202ENST00000641693 8681 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 RNF146-210ENST00000608991 2169 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 PSEN1-201ENST00000324501 6078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 AL512624.2-201ENST00000621705 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 ZNF407-203ENST00000577538 5794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 FASLG-202ENST00000367721 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 KIF4A-201ENST00000374403 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 NRXN3-207ENST00000554719 4156 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
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FOXD1Q16676 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
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FOXD1Q16676 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
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FOXD1Q16676 AC104581.5-201ENST00000624171 7141 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 ZNF521-214ENST00000584787 4327 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
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FOXD1Q16676 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
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FOXD1Q16676 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
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FOXD1Q16676 C1orf21-201ENST00000235307 10265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 CFAP54-202ENST00000524981 9766 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
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FOXD1Q16676 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
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FOXD1Q16676 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
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FOXD1Q16676 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
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