Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SP140Q13342 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SP140Q13342 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SP140Q13342 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SP140Q13342 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SP140Q13342 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
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SP140Q13342 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
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SP140Q13342 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SP140Q13342 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
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SP140Q13342 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SP140Q13342 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SP140Q13342 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SP140Q13342 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SP140Q13342 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SP140Q13342 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SP140Q13342 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SP140Q13342 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SP140Q13342 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SP140Q13342 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SP140Q13342 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SP140Q13342 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
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SP140Q13342 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
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SP140Q13342 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
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SP140Q13342 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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SP140Q13342 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SP140Q13342 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SP140Q13342 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SP140Q13342 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SP140Q13342 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
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SP140Q13342 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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SP140Q13342 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
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SP140Q13342 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SP140Q13342 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SP140Q13342 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SP140Q13342 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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