Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.9 ms