Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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TP53BP1Q12888 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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TP53BP1Q12888 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TP53BP1Q12888 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TP53BP1Q12888 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TP53BP1Q12888 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TP53BP1Q12888 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TP53BP1Q12888 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TP53BP1Q12888 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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