Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGXB3Q12766 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HMGXB3Q12766 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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