Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
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PGGT1BP53609 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
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PGGT1BP53609 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
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PGGT1BP53609 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
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PGGT1BP53609 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
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PGGT1BP53609 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
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PGGT1BP53609 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
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