Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
J3KRW8 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
J3KRW8 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
J3KRW8 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms