Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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