Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
USF2Q15853 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
USF2Q15853 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
USF2Q15853 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
USF2Q15853 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
USF2Q15853 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
USF2Q15853 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
USF2Q15853 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
USF2Q15853 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
USF2Q15853 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
USF2Q15853 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
USF2Q15853 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
USF2Q15853 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
USF2Q15853 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
USF2Q15853 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
USF2Q15853 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
USF2Q15853 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
USF2Q15853 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
USF2Q15853 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
USF2Q15853 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
USF2Q15853 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
USF2Q15853 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
USF2Q15853 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
USF2Q15853 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
USF2Q15853 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
USF2Q15853 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
USF2Q15853 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
USF2Q15853 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
USF2Q15853 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
USF2Q15853 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
USF2Q15853 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
USF2Q15853 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
USF2Q15853 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
USF2Q15853 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
USF2Q15853 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
USF2Q15853 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
USF2Q15853 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
USF2Q15853 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
USF2Q15853 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
USF2Q15853 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
USF2Q15853 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
USF2Q15853 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
USF2Q15853 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
USF2Q15853 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
USF2Q15853 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
USF2Q15853 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
USF2Q15853 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
USF2Q15853 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
USF2Q15853 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
USF2Q15853 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
USF2Q15853 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
USF2Q15853 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
USF2Q15853 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
USF2Q15853 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
USF2Q15853 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
USF2Q15853 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
USF2Q15853 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms