Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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