Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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SPIDRQ14159 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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SPIDRQ14159 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
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