Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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COL9A2Q14055 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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COL9A2Q14055 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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COL9A2Q14055 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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COL9A2Q14055 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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COL9A2Q14055 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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COL9A2Q14055 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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COL9A2Q14055 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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COL9A2Q14055 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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