| RUNX3 | Q13761 | AC130650.2-201 | ENST00000618736 | 2403 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF33CP-201 | ENST00000432492 | 2030 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HPGDS-201 | ENST00000295256 | 1636 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CLOCK-201 | ENST00000309964 | 10304 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ELAVL2-204 | ENST00000397312 | 3805 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PRKAA2-201 | ENST00000371244 | 9347 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KIF15-203 | ENST00000425755 | 3460 nt | TSL 5 BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-931P-201 | ENST00000363850 | 107 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RFPL3S-202 | ENST00000382086 | 455 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL23AP29-201 | ENST00000397284 | 453 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SSXP10-201 | ENST00000402595 | 565 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL023807.1-201 | ENST00000407932 | 359 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-55P-201 | ENST00000411092 | 107 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | PIGPP2-201 | ENST00000411569 | 458 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC098592.1-201 | ENST00000419352 | 333 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC034195.1-202 | ENST00000451031 | 610 nt | TSL 3 BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TRBV26-201 | ENST00000456572 | 344 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL359915.2-203 | ENST00000457043 | 540 nt | TSL 3 BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC010301.1-201 | ENST00000473936 | 355 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC00971-203 | ENST00000491849 | 452 nt | TSL 3 BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC093752.1-212 | ENST00000500559 | 453 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTCYBP17-201 | ENST00000503579 | 789 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC083906.5-201 | ENST00000503722 | 328 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1231P-201 | ENST00000517185 | 103 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC026904.2-201 | ENST00000521359 | 537 nt | TSL 3 BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR4A45P-201 | ENST00000529954 | 901 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LSM6P2-201 | ENST00000552208 | 177 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GTF3AP2-201 | ENST00000557014 | 266 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP005136.1-201 | ENST00000579765 | 429 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MSMB-202 | ENST00000582163 | 488 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC015908.4-201 | ENST00000582334 | 575 nt | TSL 4 BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR4999-201 | ENST00000585029 | 91 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ELOCP29-201 | ENST00000588193 | 334 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC007687.1-201 | ENST00000602704 | 304 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | YWHAQP7-201 | ENST00000603536 | 658 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR2AS2P-201 | ENST00000606902 | 342 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL512625.3-207 | ENST00000609749 | 477 nt | TSL 3 BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC105429.2-201 | ENST00000610567 | 517 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092650.2-201 | ENST00000619984 | 902 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092184.1-201 | ENST00000625042 | 715 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL121759.2-201 | ENST00000636173 | 570 nt | TSL 4 BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OXR1-206 | ENST00000449762 | 2621 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PIK3C2G-202 | ENST00000433979 | 4840 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AF127577.6-201 | ENST00000623352 | 2191 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KNL1-202 | ENST00000399668 | 7607 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL049830.3-201 | ENST00000555108 | 1991 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC005539.1-201 | ENST00000443768 | 1479 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CREBRF-201 | ENST00000296953 | 7778 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LUM-201 | ENST00000266718 | 3008 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL672296.1-201 | ENST00000427780 | 2158 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RRAS2-202 | ENST00000414023 | 1884 nt | TSL 2 BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL359893.1-201 | ENST00000447628 | 1580 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RAD21-210 | ENST00000523986 | 2506 nt | TSL 2 BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA51.6-201 | ENST00000384151 | 125 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL031121.1-201 | ENST00000406553 | 254 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01934-201 | ENST00000414750 | 391 nt | TSL 3 BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | LINC01389-201 | ENST00000420876 | 483 nt | TSL 3 BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL354941.1-201 | ENST00000438600 | 464 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MAST4-AS1-201 | ENST00000451496 | 777 nt | TSL 2 BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL606519.1-201 | ENST00000458146 | 580 nt | TSL 2 BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP000873.1-201 | ENST00000463987 | 400 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02077-201 | ENST00000465795 | 409 nt | TSL 3 BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SL330P-201 | ENST00000469709 | 307 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC117440.1-201 | ENST00000474107 | 571 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NCOR1P1-202 | ENST00000486162 | 291 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TMEM248P1-201 | ENST00000510579 | 951 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02484-201 | ENST00000513843 | 546 nt | TSL 5 BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU4ATAC3P-201 | ENST00000516699 | 126 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL137804.1-201 | ENST00000528872 | 576 nt | TSL 3 BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL356057.1-201 | ENST00000533798 | 831 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | A2ML1-AS1-201 | ENST00000537288 | 452 nt | TSL 3 BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | IAPP-204 | ENST00000539393 | 409 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RERG-IT1-201 | ENST00000539734 | 301 nt | TSL 3 BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092470.1-201 | ENST00000546187 | 132 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MRPL42-203 | ENST00000547098 | 701 nt | TSL 3 BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC087311.2-201 | ENST00000549660 | 320 nt | TSL 4 BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MRPL42-208 | ENST00000552217 | 920 nt | APPRIS P2 TSL 2 BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NR2F2-AS1-208 | ENST00000560395 | 441 nt | TSL 5 BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL353708.2-201 | ENST00000567486 | 447 nt | TSL 3 BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LARP7P2-201 | ENST00000575306 | 125 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR4425-201 | ENST00000580572 | 84 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC011509.1-201 | ENST00000589512 | 164 nt | TSL 3 BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC110760.3-201 | ENST00000598794 | 467 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | VN1R82P-201 | ENST00000601481 | 356 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC018714.1-201 | ENST00000605028 | 208 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC027045.1-201 | ENST00000609065 | 202 nt | TSL 5 BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AF117829.1-206 | ENST00000621883 | 3802 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC079248.2-201 | ENST00000623779 | 326 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CGA-204 | ENST00000627148 | 1010 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC007218.2-201 | ENST00000636913 | 179 nt | TSL 5 BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR3974-201 | ENST00000637126 | 96 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ACADM-203 | ENST00000420607 | 1332 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EVI5-201 | ENST00000370331 | 7403 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | C6orf10-204 | ENST00000447241 | 2148 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |