Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
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