Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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NR1H3Q13133 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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NR1H3Q13133 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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NR1H3Q13133 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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