Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ARID4AP29374 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms