Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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CAPN6Q9Y6Q1 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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