Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1Q9UJ41 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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