Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 UBR1-202ENST00000546274 3332 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 MKL2-209ENST00000574045 3309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 PPM1L-205ENST00000498165 10934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 EIF4G2-205ENST00000525681 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 SLA-201ENST00000338087 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 ADGRL3-214ENST00000511324 5042 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 RND3-201ENST00000263895 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 KIF1B-202ENST00000377081 8746 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 ZNF43-205ENST00000594012 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 SEMA6A-210ENST00000510263 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 BANF2-201ENST00000246090 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 AC015801.1-201ENST00000585651 153 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 ALPK1-201ENST00000177648 4537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 ROBO1-202ENST00000464233 6742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 FCGR3A-201ENST00000367967 2086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 MACROD2-203ENST00000402914 4425 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 DNM1L-207ENST00000452533 4439 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 NRXN3-201ENST00000281127 8504 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 TRIM5-202ENST00000380034 2991 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 AC099753.1-201ENST00000634947 2118 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 SLC5A1-204ENST00000543737 4752 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 UFL1-201ENST00000369278 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 AC114401.1-201ENST00000484222 2084 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 TOGARAM2-201ENST00000379558 12691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 PGM3-212ENST00000513973 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 ADAMTS9-201ENST00000295903 7060 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 DGKB-206ENST00000407950 3651 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 KIDINS220-206ENST00000473731 7248 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 ETS1-202ENST00000392668 5139 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 CLCN3-209ENST00000513761 6692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 TCF4-203ENST00000398339 2551 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 ADGRL3-209ENST00000508693 5009 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 PRICKLE2-205ENST00000638394 9956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 RN7SL199P-201ENST00000578752 281 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 BDNF-206ENST00000395983 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 OR1L8-202ENST00000641027 2024 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 LRRTM3-201ENST00000361320 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 FBXW10-202ENST00000308799 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 GJA1-201ENST00000282561 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SENP3Q9H4L4 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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